Fakultas Ilmu Kesehatan (FIKES) Universitas ‘Aisyiyah Yogyakarta (UNISA) secara resmi berdiri bersamaan dengan ditetapkannya peralihan dari Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Aisyiyah Yogyakarta menjadi Universitas Aisyiyah Yogyakarta berdasarkan Keputusan Menteri Riset, Teknologi dan Pendidikan Tinggi Republik Indonesia Nomor: 109/KPT/I/2016 tanggal 10 Maret 2016 (bertepatan dengan hari Kamis tanggal 1 Djumadil Akhir 1437 H). FIKES UNISA didirikan untuk memayungi 9 Program Studi, yaitu:
- Program Studi D3 Kebidanan
- Program Studi D4 Kebidanan
- Program Studi D4 Analis Kesehatan
- Program Studi D3 TRR
- Program Studi S1 Ilmu Keperawatan
- Program Studi S1 Fisioterapi
- Program Profesi Ners
- Program Profesi Fisioterapi
- Program Magister Kebidanan
Alhamdulillah, Surat Keputusan Menteri Riset, Teknologi dan Pendidikan Tinggi Nomor: 316/KPT/I/2017, tanggal 13 Juni 2017 tentang diberikan langsung oleh Koordinator Kopertis Wilayah V Yogyakarta, Dr. Ir. Bambang Supriyadi, CES DEA. yakni izin operational Program Studi S1 Gizi sebagai salah satu prodi terbaru di Fakultas Ilmu Kesehatan.
